No es una cuestión “moral”, es operativa:
Conectada conviene si:
quieres rutina semanal fácil,
quieres propuestas y conciliación más fluida,
no quieres depender de exportar archivos.
Manual importada conviene si:
tu banco da problemas de acceso o permisos,
prefieres no autorizar conexión,
solo quieres cargar movimientos puntuales (cierres, auditorías).
Lo que no conviene: mezclar ambas fuentes para el mismo periodo sin una regla clara, porque es cuando aparecen duplicados y confusión.